university website

T.A. Knoch (Tobias) and L.V. de Zeeuw (Luc)

2007-04-18

Erasmus Computing Grid

Publication

Publication

Het Bouwen van een 20 TeraFLOP Virtuelle Supercomputer

Presented at the Nationaal Informatica Onderwijs Congres - NIOC 2007, Amsterdam, The Netherlands, 17th - 18th April, 2007.

Het Erasmus Medische Centrum (Erasmus MC) en Hogeschool Rotterdam (HR) zijn in 2005 een unieke samenwerking begonnen om 95% van de capaciteit op al haar computers en die van anderen beschikbaar te maken voor onderzoek en onderwijs. Deze samenwerking heeft geleid tot het Erasmus Computing GRID (ECG), een virtuele supercomputer, met op dit moment een capaciteit van 5 Tera FLOPS maar na voltooiing met een capaciteit van 20 Tera (1012) FLOPS (Floting Point Operations Per Second) . Na uitvoerig testen is het ECG in productie gegaan en wordt gebruikt door tal van research groepen bij het Erasmus MC en voor onderwijs bij de HR. Wij geven u géén diepgaande technische uiteenzettingen over grid computing, daarvoor willen we u graag verwijzen naar de uitstekende vakliteratuur en de vele bronnen op het Internet. Wél voorbeelden van toepassingen en een pleidooi om grid computing binnen het onderwijs een betere basis te geven: er is behoefte aan goed opgeleide technici die een grid infrastructuur kunnen bouwen, beheren en gebruiken.

Additional Metadata
Keywords Genome, genomics, genome organization, genome architecture, structural sequencing, architectural sequencing, systems genomics, coevolution, holistic genetics, genome mechanics, genome function, genetics, gene, regulation, replication, transcription, repair, homologous recombination, simultaneous co-transfection, cell, division, mitosis, metaphase, interphase, cell nucleus, nuclear structure, nuclear organization, chromatin density, distribution, nuclear morphology, chromosome territories, subchromosomal domains, chromatin loop, aggregates, chromatin rosettes, chromatin loops, chromatin fibre, chromatin density, persistence length, spatial, distance measurement, histones, H1.0, H2A, H2B, H3, H4, mH2A1.2, DNA sequence, complete sequenced, genomes, molecular transport, obstructed diffusion, anomalous diffusion, percolation, long-range correlations, fractal analysis, scaling analysis, exact yard-stick dimension, box-counting dimension, lacunarity dimension, local nuclear dimension, nuclear diffuseness, parallel super computing, grid computing, volunteer computing, Brownian Dynamics, Monte Carlo, fluorescence in situ hybridization, confocal laser scanning microscopy, fluorescence correlation spectroscopy, super resolution microscopy, spatial precision distance microscopy, auto-, fluorescent proteins, CFP, GFP, YFP, DsRed, fusion protein, in vivo labelling, information browser, visual data, base access, holistic viewing system, integrative data management, extreme visualization, three-dimensional, virtual environment, virtual paper tool.
Persistent URL hdl.handle.net/1765/78185
Conference Nationaal Informatica Onderwijs Congres - NIOC 2007, Amsterdam, The Netherlands, 17th - 18th April, 2007.
Organisation Biophysical Genomics, Department Cell Biology & Genetics
Citation
Knoch, T., & de Zeeuw, L. (2007, April 18). Erasmus Computing Grid. Presented at the Nationaal Informatica Onderwijs Congres - NIOC 2007, Amsterdam, The Netherlands, 17th -
18th April, 2007. Retrieved from http://hdl.handle.net/1765/78185
Free Full Text ( Final Version , 3mb ) cover


User Publication Person Organisation Collection
Close